В соответствии с приказом ФТС России от 26 мая 2014 г. № 958 Контрольно-ревизионным управлением проведена проверка правомерности и эффективности использования средств федерального бюджета и федерального имущества Шереметьевской таможней за период с 1 апреля 2013 года по 31 марта 2014 года. Результаты проверки оформлены актом от 25 июня 2014 года.

Проверкой выявлены отдельные нарушения нормативных правовых актов Российской Федерации, регламентирующих порядок выплат денежного довольствия и денежного содержания должностным лицам Шереметьевской таможни, случаи несоблюдения требований федерального законодательства в сфере закупок для обеспечения федеральных нужд, а также в сфере оформления и регистрации прав пользования объектами недвижимого имущества. Большая часть финансовых нарушений была устранена Шереметьевской таможней в ходе проведения проверки.